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陳水扁總統執政五百天發表「世紀首航」新書，引起外界不同解讀。陳水扁昨天表示，他撰寫這本書是要自我反省思考，不是針對任何人士，更不是要揭發任何驚人秘辛，而是要對自己負責、對人民負責、對歷史負責。他也強調，過去有所謂的蔣總統時代，但未來絕不會有所謂「陳總統時代」，我們已經走入「人民時代」。
總統府在選前一個月發表新書，外界認為有選舉造勢的意味，陳水扁解釋，這本書規劃了一年多原本計畫在就職週年時推出，但是碰到他出國，李登輝前總統在六月也出書，而且還不斷的出，為了聞道有先後，他只好延後，之後又碰上颱風、水災、九一一事件，又嫁女兒，所以才延後至今。
陪同陳水扁出席新書發表會的吳淑珍也透露，陳水扁常常親自校對到凌晨三點多。陳水扁說，他不是第一位在任內出書的總統，包括「蔣公嘉言錄」、「台灣的主張」都是任內總統所著。他寫世紀首航，就是要「一切透明化」，不僅施政是透明的，總統府是透明的，第一家庭是透明的，軍情單位也是透明的，可以接受輿論檢驗，而一切透明化也是政黨輪替的最大好處。他強調，很多人不喜歡這本書，也有所批評，但是這是一年多來，他坦白、負責的執政告白。
陳水扁說，由於政黨輪替是第一次，沒有先例可循，很多東西的移交必須靠人的協助而不是制度的規範，所以他說，這是良心移交不是制度移交。許多國安檔案，包括兩國論、科索沃援助、九六年台海危機等會議記錄都不完整。他感謝李前總統及相關單位的協助，但還是要強調，書中檢討的不是人的問題而是制度的問題，過去沒有制度所以要建立制度，沒有典範就要建立典範。
陳總統說，不論他的任期有多久，總有卸任的一天，不管政權是和平移交給民進黨或其他政黨，他希望，都不要再發生第一次政黨輪替的缺點。他又說，透過這本書，新政府運作機制乃至總統府內互動全部攤在陽光下，因為這不是威權時代。
最後陳水扁引用美國總統林肯的一句話說，「所有被推舉到總統職位中，出身最微賤的人是我，但所承擔的責任卻最艱巨，因此能力不足之處必須求助人民大眾」。他強調，這是他一年多來的信念，祇要人民站在他這一邊，他不會感到孤單。這一本書他用將近一年的時間思考，與自己的對話，和前輩先賢的對話，也是和人民的對話，在對話反省中找尋台灣世紀首航的正確方向。